Die Aktionärsstruktur von UNIQA hat sich 2012 im Zuge der Schaffung der neuen Konzernstruktur sowie durch die Barkapitalerhöhung im Ausmaß von 500 Millionen Euro, die den bestehenden Aktionären angeboten worden ist, verändert. Die Raiffeisen Zentralbank hält 44,7 Prozent (BL Syndikat Beteiligungs Gesellschaft m.b.H. 32,8 Prozent, RZB Versicherungsbeteiligung GmbH 7,1 Prozent, UQ Beteiligung GmbH 4,8 Prozent), die Austria Privatstiftung hält 44,1 Prozent (Austria Versicherungsverein Beteiligungs-Verwaltungs GmbH 34,2 Prozent, Austria Versicherungsverein auf Gegenseitigkeit Privatstiftung 9,9 Prozent), und die Collegialität Versicherungsverein Privatstiftung hält 3,3 Prozent. Der Streubesitz liegt bei 7,5 Prozent. Der Bestand an eigenen Aktien beträgt 0,4 Prozent.